Manyetik rezonans görüntüleme (MR) ise özellikle ultrasonografi ile yeterli değerlendirme yapılamayan veya daha ayrıntılı görüntüleme gerektiren durumlarda kullanılmaktadır. Pelvik organların, uterus ve overlerin değerlendirilmesinde; jinekolojik kitlelerin karakterizasyonunda ve çeşitli hastalıkların ayrıntılı incelenmesinde önemli bir tanısal yöntemdir. Gerekli klinik durumlarda gebelik döneminde de uygun koşullar ve klinik değerlendirme doğrultusunda MR görüntüleme yapılabilmektedir.